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<div class="WordSection1" dir="ltr">

<p class="MsoNormal"><span style="font-size: inherit; color: black;">Hello!</span></p>

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<p class="MsoNormal"><span style=""><span style="color: black;"> </span></span></p>

<p class="MsoNormal"><span style=""><span style="color: black;">I'm kind of new to Relion, so I've been learning bit by bit, but now I'm stuck. I've picked particles using the Helix feature until I got pretty good classes. I used those to train a model in Topaz

 and then used that model to do autopicking. However, when I try to extract those particles, the job terminates with errors. First, I was getting the error: “ERROR: helix.cpp::convertHelicalTubeCoordsToMetaDataTable(): Input coordinates should be in pairs!”</span></span></p>

<p class="MsoNormal"><span style=""><span style="color: black;"> </span></span></p>

<p class="MsoNormal"><span style=""><span style="color: black;">I switched off the option for "Coordinates are start-end only?" and now I'm getting the error: “ERROR: helix.cpp::convertHelicalSegmentCoordsToMetaDataTable(): Prior information of helical segments

 is missing in micrographs.” The problem is probably due to the settings in Topaz and not the extraction, but I'm not sure what the exact issue is.</span></span></p>

<p class="MsoNormal"><span style=""><span style="color: black;">Any help is welcomed!</span></span><span style="font-size: inherit; color: black;"> </span></p>

<p class="MsoNormal"><span style=""><span style="color: black;">Thanks,</span></span></p>

<p class="MsoNormal"><span style=""><span style="color: black;">Irene Farinas</span></span><span style="color: black;"></span></p>

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