
<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" /></head><body style='font-size: 10pt; font-family: Verdana,Geneva,sans-serif'>

<p>wwPDB anticipates that all the four character PDB accession codes (PDB ID) will be consumed by 2029.</p>

<p>With the continuous growth of PDB archive, wwPDB has revised the PDB accession code format by extending its length and prepending “PDB” (e.g., "1abc" will become "pdb_00001abc"). This process will enable text mining detection of PDB entries in the published literature and allow for more informative and transparent delivery of revised data files.</p>

<p>Entries with extended PDB IDs (12 characters) will not be compatible with the legacy PDB file format once four-character PDB IDs are consumed. wwPDB encourages scientific journals, PDB community and users to transition to using the PDBx/mmCIF format and the extended PDB ID format as soon as possible.</p>

<p>Resources are available to help PDB users with this transition through the <a href="https://urldefense.com/v3/__http://www.wwpdb.org/documentation/new-format-for-pdb-ids__;!!Mih3wA!D_3vIHRoYs3vvPbUs15xgGinikTOR4gs8gGkCZCheLNBa0YkqjPTR0m9Ejd5EJupdQnTcerSZx8vjI2MGE_bdA5a$">wwPDB resource portal page (Extended PDB ID With 12 Characters)</a>. This page links to useful resources for handling this change, including an <a href="https://urldefense.com/v3/__http://www.wwpdb.org/documentation/pdb-id-extension-faq__;!!Mih3wA!D_3vIHRoYs3vvPbUs15xgGinikTOR4gs8gGkCZCheLNBa0YkqjPTR0m9Ejd5EJupdQnTcerSZx8vjI2MGGfNBFEA$">FAQ on PDB ID extension</a>, materials to learn more about PDBx/mmCIF format, and links to other PDBx/mmCIF resources and software tools. As the transition phase progresses, more training resources will be added to this page.</p>

<p>Additionally, a PDB “beta” archive will be provided during the transition phase in 2026. The directory structure of this “beta” archive will mirror the data organization of the <a href="https://urldefense.com/v3/__http://files-versioned.wwpdb.org/__;!!Mih3wA!D_3vIHRoYs3vvPbUs15xgGinikTOR4gs8gGkCZCheLNBa0YkqjPTR0m9Ejd5EJupdQnTcerSZx8vjI2MGIbb9ZWM$">PDB Versioned Archive</a> in the form of <a href="https://urldefense.com/v3/__https://files-beta.org/pub/pdb/data/entries/__;!!Mih3wA!D_3vIHRoYs3vvPbUs15xgGinikTOR4gs8gGkCZCheLNBa0YkqjPTR0m9Ejd5EJupdQnTcerSZx8vjI2MGNKtap1R$">https://files-beta.org/pub/pdb/data/entries/</a><em>two-letter-hash</em>/<em>pdb_accession_code</em>/<em>entry_data_File_names</em>. The two-letter hash will be based on the n-2 and n-3 characters. For example, PDB entry PDB_12345678 will be under /67/. This will maintain consistency with the current PDB archive, where e.g. PDB entry 1abc is under /ab.</p>

<p>Once all the four character PDB accession codes are consumed, this PDB “beta” archive will become the PDB main archive and the current PDB archive will be removed.</p>

<p>Download example files containing extended PDB IDs for software adoption <a href="https://urldefense.com/v3/__https://github.com/wwPDB/extended-wwPDB-identifier-examples__;!!Mih3wA!D_3vIHRoYs3vvPbUs15xgGinikTOR4gs8gGkCZCheLNBa0YkqjPTR0m9Ejd5EJupdQnTcerSZx8vjI2MGHWVAMTx$">from GitHub</a>.</p>

<p><a href="https://urldefense.com/v3/__http://www.wwpdb.org/news/news?year=2023*656f4404d78e004e766a96c6__;Iw!!Mih3wA!D_3vIHRoYs3vvPbUs15xgGinikTOR4gs8gGkCZCheLNBa0YkqjPTR0m9Ejd5EJupdQnTcerSZx8vjI2MGD8avfR6$">wwPDB recently announced that PDB three-character Chemical Component IDs have been consumed.</a> Five-character alphanumeric accession codes for CCD IDs are now issued by the OneDep system.</p>

<p>For any further information please contact us at <a href="mailto:info@wwpdb.org">info@wwpdb.org</a>.</p>

<div class="row">

<div class="pull-left" style="margin: 12px;"><a href="https://urldefense.com/v3/__http://www.wwpdb.org/documentation/new-format-for-pdb-ids__;!!Mih3wA!D_3vIHRoYs3vvPbUs15xgGinikTOR4gs8gGkCZCheLNBa0YkqjPTR0m9Ejd5EJupdQnTcerSZx8vjI2MGE_bdA5a$"><img class="img-responsive" src="https://cdn.rcsb.org/news/2024/homepage/pdbid-icon-0109024.png" alt="<I>Sample extended PDB ID</i>" /></a><small><em>Sample extended PDB ID</em></small></div>

</div>


</body></html>