<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
Hi Alicia,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">60 TB of bulk storage (maybe less usable space, depending on the raid configuration of these HDD) will be barely sufficient for working on one dataset at a time. Storage is the most overlooked of the configuration options (we are all obsessed
 with computing power, GPUs, etc.), but insufficient storage will be an endless source of problems and frustration down the road (speaking from experience…). You will be wasting GPU time if a significant fraction of the time is spent moving data around because
 the workstation’s bulk storage is full.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">So you should plan for this before buying, and m<span style="caret-color: rgb(0, 0, 0); color: rgb(0, 0, 0);" class="">y main recommendation is to get as much bulk storage as you can afford.</span></div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">I hope this helps,</div>
<div class="">
<div class="">
<div dir="auto" style="caret-color: rgb(0, 0, 0); color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
<div dir="auto" style="caret-color: rgb(0, 0, 0); color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
<div dir="auto" style="caret-color: rgb(0, 0, 0); color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
<div dir="auto" style="caret-color: rgb(0, 0, 0); color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
<div dir="auto" style="caret-color: rgb(0, 0, 0); color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;">
<br class="Apple-interchange-newline">
Guillaume</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
</div>
<div><br class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On 3 Oct 2023, at 23:18, Yingxia Hu <<a href="mailto:yhu@hexagonbio.com" class="">yhu@hexagonbio.com</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div class="">
<div dir="ltr" class="">Dear colleagues,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">I am seeking advice on building a cryo-EM workstation for data processing using RELION. Here is a draft configuration: </div>
<div class="">
<ul class="">
<li class="">1x Intel Xeon W Series CPU, 12 cores, 3.20 GHz; </li><li class="">8x32GB RAM;</li><li class="">1TB M2 drive for OS, 3.84TB U.2 NVMe drive for scratch disk;</li><li class="">3x20TB <span style="font-family:proxima-nova,sans-serif" class=""><font class="">Hard Drive (3.5" Internal - SATA/600 - 7200rpm);</font></span></li><li class="">2x Nvidia RTX A4500. </li></ul>
</div>
<div class="">Would 2x A4500 be sufficient for RELION jobs? And which one would be better between 4070 (12GB memory, faster clock speed) and A4500 (20GB, slower clock speed)? Any other advice is appreciated. Thanks in advance!</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Best,</div>
<div class="">Alicia</div>
</div>
<p class=""><br class="">
</p>
<div style="background-color: rgb(255, 255, 255); width: 100%; border: 1pt solid rgb(0, 0, 0); padding: 2pt; font-size: 10pt; line-height: 12pt; font-family: Calibri, serif, EmojiFont; text-align: left;" class="">
<span style="" class="">VARNING:</span> Klicka inte på länkar och öppna inte bilagor om du inte känner igen avsändaren och vet att innehållet är säkert.<br class="">
<span style="" class="">CAUTION:</span> Do not click on links or open attachments unless you recognise the sender and know the content is safe.</div>
</div>
_______________________________________________<br class="">
3dem mailing list<br class="">
<a href="mailto:3dem@ncmir.ucsd.edu" class="">3dem@ncmir.ucsd.edu</a><br class="">
https://mail.ncmir.ucsd.edu/mailman/listinfo/3dem<br class="">
</div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
<!DOCTYPE html>
<title>Page Title</title>
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
När du har kontakt med oss på Uppsala universitet med e-post så innebär det att vi behandlar dina personuppgifter. För att läsa mer om hur vi gör det kan du läsa här: <a href="https://urldefense.com/v3/__http://www.uu.se/om-uu/dataskydd-personuppgifter/__;!!Mih3wA!DvxlRXp-V0tTpJazTEzvEpltBLOFD0v4I8qNGw2vYIleYaTHgoiFgG5VqRBd3hwGHtYY-6-qiaSK2Zg5XPJw9Nx-GN-FJKPc$">http://www.uu.se/om-uu/dataskydd-personuppgifter/</a>
<br>
<br>
E-mailing Uppsala University means that we will process your personal data. For more information on how this is performed, please read here: <a href="https://urldefense.com/v3/__http://www.uu.se/en/about-uu/data-protection-policy__;!!Mih3wA!DvxlRXp-V0tTpJazTEzvEpltBLOFD0v4I8qNGw2vYIleYaTHgoiFgG5VqRBd3hwGHtYY-6-qiaSK2Zg5XPJw9Nx-GHmXx_cd$">http://www.uu.se/en/about-uu/data-protection-policy</a>
</body>
</html>