<div dir="ltr">Hi all,<div><br>I’ve been trying (unsuccessfully I think) to use the "--local_symmetry" additional argument in RELION 4.0. I have a seemingly OK mask_and_operators.star file, format copied from <a href="https://urldefense.com/v3/__https://www3.mrc-lmb.cam.ac.uk/relion/*index.php?title=Local_symmetry*Definition_of_local_symmetry_in_RELION__;LyM!!Mih3wA!EMkmHgXGPpKo_xjMsa5AHHS0Tad64wyWuRi7O7jmEer4BRs4KAuURtbGK1DdqLSI5ao9dDQLVXxJGGzhO-np$" target="_blank">the local symmetry documentation page</a>, and the job runs without any error message. However, I notice the output logfile reads "Applying local symmetry in real space according to 1 operators..." despite the fact that my mask_and_operators.star file describes multiple operators. I also see no difference in output map or reported resolution if I apply local symmetry, which makes me think I'm not actually applying local symmetry at all. I wonder if it has to do with the older .star file format of the mask_and_operators.star, which still has the "data_/loop_" convention of RELION 3.0.</div><div><br>Has anyone else tried to apply local symmetry during refinement jobs on RELION 4.0? Is there something I'm missing?</div><div><br>Thanks,<br>Nick</div><div><br></div><span class="gmail_signature_prefix">-- </span><br><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr">Nicholas Vangos (he/him) | PhD Candidate<div>University of Michigan</div><div>Cellular and Molecular Biology Program</div><div>Cianfrocco Lab</div></div></div></div>