
<html>

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">

<style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>

</head>

<body dir="ltr">

<div id="divtagdefaultwrapper" style="" dir="ltr">

<p style="">Dear community of structural biologists,<br>

</p>

<div style="">

<div style="">

<div id="divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="">

<div style="">

<div class="PlainText" style=""><br>

In a 3.5 Å cryo-EM reconstruction, we have discovered a large density of 10-12 Å diameter that we are having difficulty identifying (see attachment). This density is surrounded by 5 arginines, 3 asparagines, 2 glutamines, 1 aspartate, and 1 glutamate coming

 from 4 different regions of the protein. Functionally, the density is needed to hold the protein together. This density appears at higher thresholds than the protein itself and is visible even at the 2D class level. After local refinement and sharpening, the

 density becomes pyramid-like with a series of smaller spheres with pseudosymmetry (or C3?).<br>

<br>

We would be grateful for any suggestions as to what this might be.<br>

<br>

Thank you!<br>

<br>

Best regards from Dortmund,<br>

Alexander<font size="2" style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif, Helvetica, EmojiFont, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", NotoColorEmoji, "Segoe UI Symbol", "Android Emoji", EmojiSymbols; font-size: 12pt;"><br>

</font></div>

<span style="font-size: 12pt;"><font size="2"></font></span></div>

</div>

</div>

</div>

</div>

</body>

</html>