<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>
</head>
<body dir="ltr">
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;" dir="ltr">
<p>Hi,</p>
<p><br>
</p>
<p>I would like to provide better relion star files when picking filaments with crYOLO.</p>
<p><br>
</p>
<p>So far the star files crYOLO provides contain start - end coordinates. <br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>However, crYOLO is actually tracing the individual filaments and therefore they can be curvy - how do I provide those traced filaments to relion? So far we are using a detour using traced .box coordinates ( <a href="https://urldefense.com/v3/__https://cryolo.readthedocs.io/en/latest/other/other.html*import-cryolo-filament-coordinates-into-relion__;Iw!!Mih3wA!HdvpSDGhaRAa8gwB4__jNgKJjdMhj6IROxfK5eJ1SGjbqmbQZ0Hp5cy1PXnQIlySjkxhzu4nsrrJypZyVScqf9AUxMD-b6qm4S2yga7Q$" class="OWAAutoLink">https://cryolo.readthedocs.io/en/latest/other/other.html#import-cryolo-filament-coordinates-into-relion</a>
 ).  But I would rather like to provide proper formatted star files.</p>
<p><br>
</p>
<p>My guess would be that I need simply provide the individual <code>rlnCoordinateX</code> /
<code>rlnCoordinateY</code>  coordinates together with a <code>rlnHelicalTubeID</code> ? I assume I can also provide precalcualted
<code>rlnAnglePsiPrior</code> ?</p>
<p><br>
</p>
<p>Sorry, but I did not found any documentation about this. </p>
<p><br>
</p>
<p>Best,</p>
<p>Thorsten<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p><br>
</p>
<p><br>
</p>
<div id="Signature">
<div id="divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif, "EmojiFont", "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", NotoColorEmoji, "Segoe UI Symbol", "Android Emoji", EmojiSymbols;">
<p></p>
<div id="x_x_Signature" style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,serif,EmojiFont; font-size:16px">
<div name="x_x_divtagdefaultwrapper" style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif,serif,EmojiFont; margin:0px">
<p class="x_x_MsoNormal"><span style="font-size:11pt; color:rgb(117,123,128)" lang="EN-US">___________________________</span></p>
<span style="color:rgb(117,123,128)"></span>
<p class="x_x_MsoNormal"><span style="font-size:11pt" lang="EN-US"></span></p>
<span style="color:rgb(117,123,128)"></span></div>
<span style="color:rgb(117,123,128)"></span></div>
<span style="color:rgb(117,123,128)"></span>
<p class="x_x_MsoNormal"><span style="font-size:11pt; color:rgb(117,123,128)" lang="EN-US">Dr. Thorsten Wagner<br>
</span></p>
<p class="x_x_MsoNormal"><span style="font-size:11pt; color:rgb(117,123,128)" lang="EN-US">Project Group Leader - Computational Structural Biology</span></p>
<p class="x_x_MsoNormal"><span style="font-size:11pt; color:rgb(117,123,128)" lang="EN-US"><br>
</span></p>
<span style="color:rgb(117,123,128)"></span>
<div><span style="color:rgb(117,123,128)"></span>
<p class="x_x_MsoNormal"><span style="font-size:11pt; color:rgb(117,123,128)" lang="EN-US">Max-Planck-Institute of Molecular Physiology</span></p>
<span style="color:rgb(117,123,128)"></span>
<p class="x_x_MsoNormal"><span style="font-size:11pt; color:rgb(117,123,128)">Structural Biochemistry</span><br>
<span style="color:rgb(117,123,128)"></span></p>
<span style="color:rgb(117,123,128)"></span>
<p class="x_x_MsoNormal"><span style="font-size:11pt; color:rgb(117,123,128)" lang="EN-US">Otto-Hahn Strasse 11</span></p>
<span style="color:rgb(117,123,128)"></span>
<p class="x_x_MsoNormal"><span style="font-size:11pt; color:rgb(117,123,128)">D-44227 Dortmund</span></p>
<span style="color:rgb(117,123,128)"></span></div>
<span style="color:rgb(117,123,128)"></span>
<p class="x_x_MsoNormal"><span style="font-size:11pt; color:rgb(117,123,128)">Phone +49-(0)231-133-2302</span></p>
<span style="color:rgb(117,123,128)"></span>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,serif,EmojiFont; font-size:16px; margin-top:0px; margin-bottom:0px">
<span style="color:rgb(117,123,128)">Room: B.2.29</span></div>
<p></p>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>