<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
<span style="font-size: 14px;" class=""><br class="">
</span>
<div><span style="font-size: 14px;" class="">Hi Juan,</span></div>
<div><br class="">
</div>
<div><span style="font-size: 14px;" class="">Hope you are well.</span></div>
<div><span style="font-size: 14px;" class=""><br class="">
</span></div>
<div><span style="font-size: 14px;" class="">I think it’s a general phenomenon that there are much more autofluorescence (fluo background as you said) detected in cryo temperature, especially mammalian cells. You may have seen or could check this paper reporting
 the similar issue:  <span style="text-indent: -36px;" class="">Carter, S. D., Mageswaran, S. K., Farino, Z. J., Mamede, J. I., Oikonomou, C. M., Hope, T. J., Freyberg, Z., & Jensen, G. J. (2018). Distinguishing signal from autofluorescence in cryogenic correlated
 light and electron microscopy of mammalian cells. </span><i style="text-indent: -36px;" class="">J Struct Biol</i><span style="text-indent: -36px;" class="">,</span><i style="text-indent: -36px;" class=""> 201</i><span style="text-indent: -36px;" class="">(1),
 15-25. <a href="https://urldefense.com/v3/__https://doi.org/10.1016/j.jsb.2017.10.009__;!!Mih3wA!HZbRUUWHg4Fs8iMo-y6cRGVbXFPHGIW5Qp6xuo_qTVJI5WC3HqxTEgGbJt_dzhutI0Yygx5fy1pUK6GOz6kda-M2WjAJd-Lsme0$" class="">https://doi.org/10.1016/j.jsb.2017.10.009</a></span><span style="text-indent: -36px;" class=""> </span></span></div>
<div>
<div class=""><span style="font-size: 14px;" class=""><br class="">
</span></div>
<div class=""><span style="font-size: 14px;" class="">I also see more autofluorescence in my sample in cryo temperature than RT, especially in green channel. My guess is that in RT the autofluorescence get quenched soon after imaging, but in cryo any fluorescence
 gets barely quenched or very slow to get quenched (at least by non-laser light source as Leica cryoCLEM).</span></div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><span style="font-size: 14px;" class="">Best wishes,</span></div>
<div class=""><span style="font-size: 14px;" class="">Joy</span></div>
<div class=""><span style="font-size: 14px;" class=""><br class="">
</span></div>
<div class=""><span style="font-size: 14px;" class=""><br class="">
</span></div>
<div class=""><span style="font-size: 14px;" class=""><br class="">
</span></div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
</div>
<div><br class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On 25 Aug 2022, at 12:34, Juan Shen <<a href="mailto:juan.shen@strubi.ox.ac.uk" class="">juan.shen@strubi.ox.ac.uk</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div class="elementToProof" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;">
Hi all,</div>
<div class="elementToProof" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;">
<br class="">
</div>
<div class="elementToProof" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;">
We are trying to image tagged VLPs in cells using Leica cryo CLEM. Our sample looks good under the regular confocal microscope with bright particles. However, the cell fluorescence background is relatively high <span style="background-color: rgb(255, 255, 255); display: inline !important;" class="">u</span><span style="margin: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255); display: inline !important;" class="">nder
 the Leica cryo CLEM microscopy.</span></div>
<div class="elementToProof" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;">
<br class="">
</div>
<div class="elementToProof" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;">
We have tried using FluoroBrite DMEM media or different cell lines but the problem is still there. I was wondering if anyone had a similar problem when imaging cell samples using cryo CLEM? Thank you.</div>
<div class="elementToProof" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;">
<br class="">
</div>
<div class="elementToProof" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;">
Best wishes,</div>
<div class="elementToProof" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;">
Juan</div>
<div class="elementToProof" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;">
<br class="">
</div>
<div class="elementToProof" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;">
<br class="">
</div>
<div style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">
<br class="">
</div>
<div id="Signature" class="">
<div class="">
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">
<div style="margin: 0px; font-size: 15px; color: rgb(50, 49, 48); text-align: start; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
<div style="margin: 0px; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="margin: 0px; font-size: 10pt; font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;" class="">-----------------------------------------------</span></div>
<div style="margin: 0px; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="margin: 0px; font-size: 10pt; font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;" class="">Juan Shen</span></div>
</div>
<div style="margin: 0px; font-size: 15px; color: rgb(50, 49, 48); text-align: start; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
<p style="margin: 0px; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="margin: 0px; font-size: 10pt; font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;" class=""> </span></p>
</div>
<div style="margin: 0px; font-size: 15px; color: rgb(50, 49, 48); text-align: start; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
<div style="margin: 0px; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="margin: 0px; font-size: 10pt; font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;" class="">Lab manager of Prof Peijun Zhang's group</span></div>
</div>
<div style="margin: 0px; font-size: 15px; color: rgb(50, 49, 48); text-align: start; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
<p style="margin: 0px; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="margin: 0px; font-size: 10pt; font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;" class=""> </span></p>
</div>
<div style="margin: 0px; font-size: 15px; color: rgb(50, 49, 48); text-align: start; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
<div style="margin: 0px; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="margin: 0px; font-size: 10pt; font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;" class="">Wellcome Centre for Human Genetics</span><span style="margin: 0px; font-size: 10pt;" class=""><br class="">
</span><span style="margin: 0px; font-size: 10pt; font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;" class="">University of Oxford</span><span style="margin: 0px; font-size: 10pt;" class=""><br class="">
</span><span style="margin: 0px; font-size: 10pt; font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;" class="">Old Road Campus</span><span style="margin: 0px; font-size: 10pt;" class=""><br class="">
</span><span style="margin: 0px; font-size: 10pt; font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;" class="">Roosevelt Drive, Oxford OX3 7BN</span></div>
</div>
<div style="margin: 0px; font-size: 15px; color: rgb(50, 49, 48); text-align: start; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
<div style="margin: 0px; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="margin: 0px; font-size: 10pt; font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;" class="">Tel: 01865 287723</span></div>
</div>
<br class="">
</div>
</div>
</div>
</div>
<span style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; float: none; display: inline !important;" class="">_______________________________________________</span><br style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
<span style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; float: none; display: inline !important;" class="">3dem
 mailing list</span><br style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
<a href="mailto:3dem@ncmir.ucsd.edu" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">3dem@ncmir.ucsd.edu</a><br style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
<a href="https://mail.ncmir.ucsd.edu/mailman/listinfo/3dem" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">https://mail.ncmir.ucsd.edu/mailman/listinfo/3dem</a></div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</body>
</html>