<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none;"> P {margin-top:0;margin-bottom:0;} </style>
</head>
<body dir="ltr">
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">
Dear all,</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">
I am working with two tomogram datasets collected using two separate Krios microscopes and I've been picking particles to perform STA. I have somewhat successfully processed these using Relion to a resolution of 20 A but I've been experimenting with emClarity
 in an attempt to improve it further. There is a small pixel size difference (4.377 A and 4.53 A), which I've previously accounted for by resizing the processed tomogram with the smaller pixel size through IMOD to match the larger one. I was looking for a different
 approach to this as I realise that this is probably a terrible way to combine two datasets!</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">
<br>
</div>
<div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
For emClarity I need to work with the tilt series, so I was thinking that I should do a (non-integer) fourier crop the tilts from one dataset so they match with the other, and I was wondering if anyone has any experience of the best way to do this? Also, would
 this invalidate the alignments performed in IMOD and require me to reprocess the tilt series?</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
Cheers,</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
Mat<br>
</div>
<div id="Signature">
<div>
<div></div>
<div></div>
<div id="divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif;">
<p style="margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-top:0; margin-bottom:0"><br>
</p>
<p style="margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-top:0; margin-bottom:0">----------</p>
<p style="margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-top:0; margin-bottom:0"><br>
</p>
<p style="margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-top:0; margin-bottom:0">Dr Mathew McLaren</p>
<p style="margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-top:0; margin-bottom:0">TEM Experimental Officer</p>
<p style="margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-top:0; margin-bottom:0">Living Systems Institute</p>
<p style="margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-top:0; margin-bottom:0">University of Exeter</p>
<p style="margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-top:0; margin-bottom:0">T: +44(0)1392 72<b>7468</b></p>
<p style="margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-top:0; margin-bottom:0">E: m.mclaren@exeter.ac.uk</p>
<p style="margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-top:0; margin-bottom:0"><br>
</p>
<div style="margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-top:0; margin-bottom:0">My pronouns are he / him / his.<br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>