<div dir="ltr">Hi all.<div><div><br></div><div>Our lab is also currently making similar considerations for a moderately large server. So this email chain has been quite serendipitous.</div><div><br></div><div>I'm wondering whether those (Chen, Steve, Matthias, Tim) with external servers (45drives, trueNAS, synology, etc) might comment on their network setup? Did you opt for a special network switch? Has this been necessary or can these servers directly host the workstations? What kind of local network infrastructure do you use? Connections, SFP+/RJ45/some fancy optical thing?</div><div><br></div><div>I note Steve has said, in the small 12-drive synologyNAS that a 10Gbe (RJ45?) card has been sufficient for ~950/600 MB/s IO. I recall the synology can be networked directly to workstations without the need for a switch, if I'm not mistaken. So what is people's experience with the other larger servers? </div><div><br></div><div>Perhaps you might also comment on your typical use case? E.g. is your server for long term storage of processed or raw data? Or is it rather a scratch space for analysis with read & write? </div><div><br></div><div>Very best,</div><div>Charles</div><div><div><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div style="font-size:12.8px"><span style="font-size:small">_________________</span><font size="2"><b style="font-family:"arial narrow",sans-serif"><br></b></font></div><div style="font-size:12.8px"><span style="font-size:small"><br></span></div><div style="font-size:12.8px"><font size="2"><b style="font-family:"arial narrow",sans-serif">Charles Bayly-Jones</b><br></font></div><div style="font-size:12.8px"><font face="arial narrow, sans-serif" size="2">BSc(ScSchProg)(Hons)</font></div><div style="font-size:12.8px"><div style="font-size:12.8px"><br></div></div><div style="font-size:12.8px"><font face="arial narrow, sans-serif" size="2"><b>Monash Biomedicine Discovery Institute & </b></font><b style="font-size:small;font-family:"arial narrow",sans-serif">ARC CoE in advanced molecular imaging</b></div><div><font face="arial narrow, sans-serif" size="2" style="font-size:12.8px"><b>Department of Biochemistry and Molecular Biology </b></font></div><div style="font-size:12.8px"><font face="arial narrow, sans-serif" size="2">Rm 218, Level 2, Building 77</font></div><div style="font-size:12.8px"><font face="arial narrow, sans-serif" size="2">23 Innovation Walk</font></div><div style="font-size:12.8px"><font face="arial narrow, sans-serif" size="2">Clayton VIC 3800</font></div><div style="font-size:12.8px"><font face="arial narrow, sans-serif" size="2">Australia</font></div><div style="font-size:12.8px"><img src="https://www.monash.edu/__data/assets/image/0006/1087638/monash-logo.jpg" alt="Image result for monash university logo" width="200" height="37"><font face="arial narrow, sans-serif" size="2"><br></font></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div><br></div></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Sat, 3 Apr 2021 at 04:23, Xu, Chen <<a href="mailto:Chen.Xu@umassmed.edu">Chen.Xu@umassmed.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">We also have very positive experience with FreeNAS/TruNAS system. Here is the shop for their<br>
on-the-shelf units.<br>
<br>
<a href="https://urldefense.com/v3/__https://www.amazon.com/stores/iXsystems/page/C88EFDE3-3E4C-4951-860E-0E8A8BD91BF9?ref_=ast_bln__;!!Mih3wA!XMzGwejDpzMf8LVPKLKH7ywovtHBrbzH4RFa7s3_HCHKfln9EJAtGF_JwCOnSJxj9w$" rel="noreferrer" target="_blank">https://urldefense.com/v3/__https://www.amazon.com/stores/iXsystems/page/C88EFDE3-3E4C-4951-860E-0E8A8BD91BF9?ref_=ast_bln__;!!Mih3wA!XMzGwejDpzMf8LVPKLKH7ywovtHBrbzH4RFa7s3_HCHKfln9EJAtGF_JwCOnSJxj9w$</a> <br>
<br>
-Chen<br>
<br>
________________________________________<br>
From: 3dem <<a href="mailto:3dem-bounces@ncmir.ucsd.edu" target="_blank">3dem-bounces@ncmir.ucsd.edu</a>> on behalf of Matthias Wolf <<a href="mailto:matthias.wolf@oist.jp" target="_blank">matthias.wolf@oist.jp</a>><br>
Sent: Friday, April 2, 2021 11:27 AM<br>
To: Krishan Pandey; <a href="mailto:3dem@ncmir.ucsd.edu" target="_blank">3dem@ncmir.ucsd.edu</a><br>
Subject: Re: [3dem] Data storage system<br>
<br>
Hi Krishan,<br>
<br>
Our 60-drive 760 TB FreeNAS has been running flawless since more than 1 year. One failed drive was easily hot swapped. If you want capacity, this does not cost more  per TB than inferior hardware, yet you get good redundancy and performance.<br>
<br>
See my old tweet here <a href="https://urldefense.com/v3/__https://twitter.com/hicryoem/status/1223966559976083458?s=21__;!!Mih3wA!XMzGwejDpzMf8LVPKLKH7ywovtHBrbzH4RFa7s3_HCHKfln9EJAtGF_JwCPmSkFojQ$" rel="noreferrer" target="_blank">https://urldefense.com/v3/__https://twitter.com/hicryoem/status/1223966559976083458?s=21__;!!Mih3wA!XMzGwejDpzMf8LVPKLKH7ywovtHBrbzH4RFa7s3_HCHKfln9EJAtGF_JwCPmSkFojQ$</a> <<a href="https://urldefense.com/v3/__https://nam10.safelinks.protection.outlook.com/?url=https*3A*2F*2Furldefense.com*2Fv3*2F__https*3A*2F*2Ftwitter.com*2Fhicryoem*2Fstatus*2F1223966559976083458*3Fs*3D21__*3B!!Mih3wA!TpItSV7E6sE1qSO0JgCwUfuLYuNhW92PMSZUaIF70zdj2z4BE_zg2izktUsKL5clRQ*24&data=04*7C01*7CChen.Xu*40umassmed.edu*7Ca3ecd1c220144d5c148208d8f5ebdb95*7Cee9155fe2da34378a6c44405faf57b2e*7C0*7C1*7C637529740649781691*7CUnknown*7CTWFpbGZsb3d8eyJWIjoiMC4wLjAwMDAiLCJQIjoiV2luMzIiLCJBTiI6Ik1haWwiLCJXVCI6Mn0*3D*7C2000&sdata=kHkXkbLqxxMR*2F*2FgoMCQQQxjSAvsIXrzIxrf93xWYXrE*3D&reserved=0__;JSUlJSUlJSUlJSUlJSUlJSUlJSUlJSUlJSUlJSUl!!Mih3wA!XMzGwejDpzMf8LVPKLKH7ywovtHBrbzH4RFa7s3_HCHKfln9EJAtGF_JwCOaPADKzw$" rel="noreferrer" target="_blank">https://urldefense.com/v3/__https://nam10.safelinks.protection.outlook.com/?url=https*3A*2F*2Furldefense.com*2Fv3*2F__https*3A*2F*2Ftwitter.com*2Fhicryoem*2Fstatus*2F1223966559976083458*3Fs*3D21__*3B!!Mih3wA!TpItSV7E6sE1qSO0JgCwUfuLYuNhW92PMSZUaIF70zdj2z4BE_zg2izktUsKL5clRQ*24&data=04*7C01*7CChen.Xu*40umassmed.edu*7Ca3ecd1c220144d5c148208d8f5ebdb95*7Cee9155fe2da34378a6c44405faf57b2e*7C0*7C1*7C637529740649781691*7CUnknown*7CTWFpbGZsb3d8eyJWIjoiMC4wLjAwMDAiLCJQIjoiV2luMzIiLCJBTiI6Ik1haWwiLCJXVCI6Mn0*3D*7C2000&sdata=kHkXkbLqxxMR*2F*2FgoMCQQQxjSAvsIXrzIxrf93xWYXrE*3D&reserved=0__;JSUlJSUlJSUlJSUlJSUlJSUlJSUlJSUlJSUlJSUl!!Mih3wA!XMzGwejDpzMf8LVPKLKH7ywovtHBrbzH4RFa7s3_HCHKfln9EJAtGF_JwCOaPADKzw$</a> ><br>
<br>
   Matthias<br>
<br>
________________________________<br>
From: 3dem <<a href="mailto:3dem-bounces@ncmir.ucsd.edu" target="_blank">3dem-bounces@ncmir.ucsd.edu</a>> on behalf of Krishan Pandey <<a href="mailto:krishan.pandey@health.slu.edu" target="_blank">krishan.pandey@health.slu.edu</a>><br>
Sent: Friday, April 2, 2021 03:59<br>
To: <a href="mailto:3dem@ncmir.ucsd.edu" target="_blank">3dem@ncmir.ucsd.edu</a><br>
Subject: [3dem] Data storage system<br>
<br>
Hello,<br>
<br>
I am requesting suggestions and cost estimates about off the shelf data storage systems to store raw cryo-EM movies and processed data for our lab. Our initial target is 150-200 TB with options to expand it in future.<br>
We don't have much local IT support for Linux based systems, that's why I am asking for an off-the shelf system which should be easier to install and manage.<br>
<br>
Thank you<br>
best regards<br>
<br>
Krishan Pandey<br>
<br>
_______________________________________________<br>
3dem mailing list<br>
<a href="mailto:3dem@ncmir.ucsd.edu" target="_blank">3dem@ncmir.ucsd.edu</a><br>
<a href="https://mail.ncmir.ucsd.edu/mailman/listinfo/3dem" rel="noreferrer" target="_blank">https://mail.ncmir.ucsd.edu/mailman/listinfo/3dem</a><br>
</blockquote></div>