<div dir="ltr"><div dir="ltr">Dear Kelly,<div><br></div><div>your UCSD colleague recently asked about a good configuration for a Krios setup: <a href="https://urldefense.com/v3/__https://groups.google.com/g/warp-em/c/9ZJB1I3Hz-w__;!!Mih3wA!UoIvjNIn1vFZ2RwjydJFs2Cf8RR2oU0U4qe2--r-8rLxk91diWl1nIOKfVfNhxfcPA$">https://groups.google.com/g/warp-em/c/9ZJB1I3Hz-w</a></div><div><br></div><div>Depending on the throughput you expect from your Arctica and the sensor size, you could go with the lower-end configuration, or the one I suggested. In our lab all microscopes write to a central file server, which the machines running Warp also can access to process the files as they arrive. If you're working with compressed TIFFs, the throughput is not very high, but I'd still recommend a 10 Gb network interface for all end points. In this setup there are virtually no requirements for local storage on the Warp machine.</div><div><br></div><div>Cheers,</div><div>Dimitry</div></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Tue, Oct 6, 2020 at 9:37 PM Mcguire, Kelly <<a href="mailto:klmcguire@ucsd.edu">klmcguire@ucsd.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">





<div lang="EN-US" style="overflow-wrap: break-word;">
<div class="gmail-m_5067237300654567665WordSection1">
<p class="MsoNormal">Our lab is considering building a WARP machine for our Arctica and we are looking for some advice on computer specs that some of you use in your setup. We would like to know the CPU (# of cores), RAM size, type and number of GPUs, and amount
 of hard drive space you have in your WARP machine. Also, any information on the WARP machine interface with Arctica would be greatly appreciated. Thanks!<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">Dr. Kelly McGuire<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Biophysicist – Postdoc<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Department of Chemistry and Biochemistry<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">UC San Diego<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
</div>

_______________________________________________<br>
3dem mailing list<br>
<a href="mailto:3dem@ncmir.ucsd.edu" target="_blank">3dem@ncmir.ucsd.edu</a><br>
<a href="https://mail.ncmir.ucsd.edu/mailman/listinfo/3dem" rel="noreferrer" target="_blank">https://mail.ncmir.ucsd.edu/mailman/listinfo/3dem</a><br>
</blockquote></div>