<div dir="ltr">Dear 3DEM community,<div><br></div><div>I hope you are well!<br><div><br></div><div>I am using Inspect3D together with Amira for the 3D visualisation of membrane structures inside the a cell: ER and Golgi, etc. My raw data is a TEM tilt series (room temperature) acquired with the FEI Tomography software. The membranes in the reconstructed volume (SIRT 20 iterations) are clearly visible by eye, but the reconstructed volume is quite noisy since the sample cannot be heavily contrasted. I would like to automate the visualisation process as much as possible before turning to manual segmentation as a last resort. The Volume rendering process in Amira suffers a lot from the noise, so I am looking for advice. Is it a waste of time to try to de-noise the volume?</div><div><br></div><div>Is anyone else doing something similar? Can you suggest a usable workflow for working with TEM volumes containing noise in Amira (a publication or your own experience perhaps)?</div><div><br></div><div>Stay safe,</div><div>Charlotte</div></div></div>