<div dir="ltr">Hi all,<div><br></div><div>When aligning a frame stack with Motioncor2, is there an option to detect frames with black areas of the image that didn't make it out of the K2 digitizer, and toss those frames?  This doesn't happen to me very often, but sometimes I get a bad frame in a stack of ~10 frames.  I'm happy to throw away that one funky frame, but doing it manually is a bit of a pain.  Dimitry Tegunov's K2Align has the functionality, and it works well:  <a href="https://github.com/dtegunov/k2align">https://github.com/dtegunov/k2align</a>.  But Iike motioncor2's patch-based alignment, so it would be cool to also have that "throw away frames with black boxes" over there.  </div><div><br></div><div>Am I missing it?</div><div><a href="https://hpc.nih.gov/apps/RELION/MotionCor2-UserManual-05-03-2018.pdf">https://hpc.nih.gov/apps/RELION/MotionCor2-UserManual-05-03-2018.pdf</a><br></div><div><br></div><div>Best,</div><div>Ben</div></div>