<div dir="ltr"><div dir="ltr"><div>Dear<span class="gmail-qu" tabindex="-1"><span name="Pranav Shah" class="gmail-gD"> Pranav Shah</span><br></span></div><div><br></div><div>Our camera normalisation program should be able to correct your "screwey <span class="gmail-il">gain</span> reference" treated data set...   It improves even on "correctly" gain corrected data sets!</div><div>The condition is that the dataset should be large enough (> ~1000 movie frames).  Moreover the 
"screwey <span class="gmail-il">gain</span> reference", that you corrupted your data with, should not contain anomalities, like both negative and positive values, or undefinined/overflow floating point values.   That being the case you should able to salvage the data with our program.<br></div><div>Cheers</div><div>Marin<br></div><div><br></div><div>For details see: <a href="https://www.nature.com/articles/srep10317">https://www.nature.com/articles/srep10317</a><br></div><div><span class="gmail-qu" tabindex="-1"></span></div><br>

</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Thu, Mar 14, 2019 at 5:27 AM Pranav Shah <<a href="mailto:p.shah.lab@gmail.com">p.shah.lab@gmail.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Dear Community,<br>
<br>
Due to an inadvertent mistake I ended up collecting a dataset<br>
normalised with a screwey gain ref and I was wondering if there was an<br>
in silico way to fix this mistake. Has anyone had a similar problem<br>
and managed to save their precious data?<br>
<br>
Looking forward to your suggestions.<br>
Cheers,<br>
Pranav<br>
--<br>
Pranav Shah<br>
Postdoctoral Research Fellow.<br>
<br>
Hogle Lab<br>
Department of Biological Chemistry and Molecular Pharmacology,<br>
Building C2 - First Floor<br>
240 Longwood Avenue<br>
Boston, MA 02115<br>
(617) 432-4360 (fax)<br>
(617) 432-3839 (lab)<br>
<br>
########################################################################<br>
<br>
To unsubscribe from the CCPEM list, click the following link:<br>
<a href="https://www.jiscmail.ac.uk/cgi-bin/webadmin?SUBED1=CCPEM&A=1" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.jiscmail.ac.uk/cgi-bin/webadmin?SUBED1=CCPEM&A=1</a><br>
</blockquote></div>