<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none"><!-- p { margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; }--></style>
</head>
<body dir="ltr" style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#FFFFFF;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;">
<p>I think the program rivem (radial interpretation of virus electron-density map) will allow you to do this.  <br>
</p>
<p><br>
</p>
<p><a href="http://utminers.utep.edu/cxiao/programs/RIVEM.shtml">http://utminers.utep.edu/cxiao/programs/RIVEM.shtml</a>​<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p><br>
</p>
<p><br>
</p>
<div id="Signature">
<div name="divtagdefaultwrapper" style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:; margin:0">
Reza Khayat, PhD
<div>Assistant Professor </div>
<div>City College of New York</div>
<div>Department of Chemistry</div>
<div>New York, NY 10031</div>
</div>
</div>
<div dir="ltr" style="color: rgb(33, 33, 33);">
<hr tabindex="-1" style="display:inline-block; width:98%">
<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>From:</b> 3dem <3dem-bounces@ncmir.ucsd.edu> on behalf of Steinar Halldorsson <steinar.halldorsson@crick.ac.uk><br>
<b>Sent:</b> Tuesday, February 12, 2019 11:41 AM<br>
<b>To:</b> 3dem@ncmir.ucsd.edu<br>
<b>Subject:</b> [EXTERNAL] [3dem] Surface projection maps.</font>
<div> </div>
</div>
<div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
Hi all</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
I would like to do something which I'm hoping that someone else has done before, or at least something similar and might have a solution to share.</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
I have some raw tomograms of spherical-ish viral particles and I would like to create a flattened (projected) 2D image of the surface of a single virion. I'm thinking that it would be sort of like making a world map using the Mercator projection, i.e. projecting
 a sphere onto a cylinder and "rolling out" the cylinder. Ideally there would be a way to average several pixels in each direction to enhance the contrast in the tomogram.</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
Has anyone seen something like this done in a publication or has even done something like this themselves?</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
Best wishes,</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
Steinar</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<p style="color:rgb(112,113,115); font-family:'Trebuchet MS','Lucida Grande'; font-style:italic; font-size:10pt">
The Francis Crick Institute Limited is a registered charity in England and Wales no. 1140062 and a company registered in England and Wales no. 06885462, with its registered office at 1 Midland Road London NW1 1AT</p>
</div>
</div>
</body>
</html>