<div dir="ltr"><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">Dear Julien, <div><br></div><div>You can use Scipion to do that. </div><div>When running movie alignment (motioncor2, unblur, xmipp3, etc) you can active an option</div><div>to generate a thumbnail and then after CTF estimation (gctf, ctffind4, etc) you will have a GUI (see</div><div>figure below) where you can sort by any column (estimated resoltion, quality fit, defocus, etc)</div><div>and select/deselect micrographs and create a new subset. You can also change to a view to see</div><div>a gallery of all thumbnails (real space micrograph) or a gallery of all PSDs images, this also helps</div><div>to screen the micrographs quickly in some cases. If you don't want to continue processing</div><div>inside Scipion, you could easily export micrographs + CTF (protocol 'relion - export ctf') and then</div><div>proceed in Relion.</div><div><br></div><div>Please let me know if you want to give it a try and have any further questions.</div><div><br></div><div>Kind regards,</div><div>Jose Miguel</div></div><div><br></div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div></div><div><div><img src="cid:ii_jotvrg7d0" alt="image.png" width="563" height="371"><br></div></div><div><div><br></div></div></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Thu, Nov 22, 2018 at 6:18 PM Julien Bous <<a href="mailto:julien.bous@etu.umontpellier.fr" target="_blank">julien.bous@etu.umontpellier.fr</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Dear All,<br>
<br>
I wish to realise a sorting of my realigned micrographs in Relion3, in <br>
order to get rid of broken ice area. I wanted to do it in the subset <br>
selection mode but I was not able to set a lowpass filter in this mode <br>
and it was challenging to asses the micrographs quality. I thougt to do <br>
it in the manual picking mode or manually, with eman , but in this way I <br>
can just display the micrographs one by one and it'll be very time <br>
consuming. Therefore if anyone  knows how to realise this task <br>
effectively I'll be glad to know your opinion.<br>
<br>
Cheers,<br>
<br>
Julien<br>
<br>
_______________________________________________<br>
3dem mailing list<br>
<a href="mailto:3dem@ncmir.ucsd.edu" target="_blank">3dem@ncmir.ucsd.edu</a><br>
<a href="https://mail.ncmir.ucsd.edu/mailman/listinfo/3dem" rel="noreferrer" target="_blank">https://mail.ncmir.ucsd.edu/mailman/listinfo/3dem</a><br>
</blockquote></div>
</blockquote></div></div>