
<html>

  <head>


    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=utf-8">

  </head>

  <body text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">

    <p>Hi Everybody,</p>

    <p>I wonder if you can help me, any suggestions are welcome:</p>

    <p>We need to process particles that are big enough and fit only in

      the boxes of the size 900x900. I do not want to coarsen them.</p>

    <p>Is there any way I can process them in CryoSparc (ver 2), or

      Relion 3? So far  CryoSparc2 crashes at 2D classification

      complaining that : <b>cufftAllosFailed</b></p>

    <p>If I want to have 100  or 20 classes it fails in ~5min, with 5

      classes it failed after iteration #19. The error message is the

      same. <br>

    </p>

    <p>Relion 3 was more efficient: running two (2) month for 50

      classes  reaching the iteration #2. Then the guy was mercilessly

      killed.</p>

    <p>I am using 4 GPU with the memory of ~ 12Gb each<br>

    </p>

    <p>Set consists of ~ 35 000 images.<br>

    </p>

    Many thanks in advance. Elena<br>

    <pre class="moz-signature" cols="72">~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~

Elena Orlova

Crystallography, Institute for Structural and Molecular Biology, 

Department of Biological Sciences 

Birkbeck,  University of London, 

Malet Street, 

LONDON  WC1E 7HX 

Tel: (+44) (0)20 7631 6845

Fax: (+44) (0)20 7631 6803

e-mail: <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:e.orlova@mail.cryst.bbk.ac.uk">e.orlova@mail.cryst.bbk.ac.uk</a>


</pre>

  </body>

</html>