<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
</head>
<body dir="auto">
Dear Eric
<div><br>
</div>
<div>I did send Reza a simple program. I can send it to you, but it requires SPHIRE installation. If you have one, it is easy to use...<br>
<br>
<div id="AppleMailSignature">Regards,
<div>Pawel</div>
</div>
<div><br>
On Jul 23, 2018, at 12:24 AM, Eric Hanssen <<a href="mailto:ehanssen@unimelb.edu.au">ehanssen@unimelb.edu.au</a>> wrote:<br>
<br>
</div>
<blockquote type="cite">
<div>
<meta name="Generator" content="Microsoft Word 14 (filtered medium)">
<!--[if !mso]><style>v\:* {behavior:url(#default#VML);}
o\:* {behavior:url(#default#VML);}
w\:* {behavior:url(#default#VML);}
.shape {behavior:url(#default#VML);}
</style><![endif]--><style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Tahoma;
        panose-1:2 11 6 4 3 5 4 4 2 4;}
@font-face
        {font-family:"Comic Sans MS";
        panose-1:3 15 7 2 3 3 2 2 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Times New Roman","serif";}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:purple;
        text-decoration:underline;}
p
        {mso-style-priority:99;
        margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Times New Roman","serif";}
p.MsoAcetate, li.MsoAcetate, div.MsoAcetate
        {mso-style-priority:99;
        mso-style-link:"Balloon Text Char";
        margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:8.0pt;
        font-family:"Tahoma","sans-serif";}
span.EmailStyle18
        {mso-style-type:personal-reply;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        color:#1F497D;}
span.BalloonTextChar
        {mso-style-name:"Balloon Text Char";
        mso-style-priority:99;
        mso-style-link:"Balloon Text";
        font-family:"Tahoma","sans-serif";}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-size:10.0pt;}
@page WordSection1
        {size:612.0pt 792.0pt;
        margin:72.0pt 72.0pt 72.0pt 72.0pt;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]-->
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">HI Reza,
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Any chance someone sent you something that you would be willing toshare. I have similar issue.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Regards<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Eric<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<div>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Comic Sans MS";color:navy">-----------------<o:p></o:p></span></b></p>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Comic Sans MS";color:navy">Assoc. Prof Eric Hanssen<o:p></o:p></span></b></p>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Comic Sans MS";color:navy"><o:p> </o:p></span></b></p>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Comic Sans MS";color:#1F497D">Head - Advanced Microscopy Facility
</span></b><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Comic Sans MS";color:#1F497D"><o:p></o:p></span></b></p>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Comic Sans MS";color:#1F497D">Honorary Principal Fellow – Department of Biochemistry and Molecular Biology<o:p></o:p></span></b></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Comic Sans MS";color:#1F497D"><br>
Bio21 Molecular Science and Biotechnology Institute<br>
</span><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Comic Sans MS";color:gray">30 Flemington Road - The University of Melbourne - Victoria 3010 - Australia<br>
email: </span><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><a href="mailto:ehanssen@unimelb.edu.au"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Comic Sans MS";color:gray">ehanssen@unimelb.edu.au</span></a></span><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Comic Sans MS";color:gray">
 | Office: +61 3 83442449 | Microscope: +61 3 83442509 <o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Comic Sans MS";color:gray">Web:
<a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__www.microscopy.unimelb.edu.au_&d=DwMGaQ&c=6vgNTiRn9_pqCD9hKx9JgXN1VapJQ8JVoF8oWH1AgfQ&r=vDDf9rsFxPMXm8JgJa6hc4B9V4qKr7wftnDkLIRdshI&m=JSnwF2gEnjjfAzF_6H92TsLVPsztPJx6B_bs5h-CqgQ&s=ruYpsUCXN4O-FKm4IY3eZwaE3sC6WuoelbDhaL1xmGs&e=">
www.microscopy.unimelb.edu.au</a><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><image001.png><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
</div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0cm 0cm 0cm">
<p class="MsoNormal"><b><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">From:</span></b><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif""> 3dem [<a href="mailto:3dem-bounces@ncmir.ucsd.edu">mailto:3dem-bounces@ncmir.ucsd.edu</a>]
<b>On Behalf Of </b>Reza Khayat<br>
<b>Sent:</b> Tuesday, 17 July 2018 5:20 AM<br>
<b>To:</b> <a href="mailto:3dem@ncmir.ucsd.edu">3dem@ncmir.ucsd.edu</a><br>
<b>Subject:</b> [3dem] Removing orientation bias<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p><span style="font-family:"Calibri","sans-serif";color:black">​Hi,<o:p></o:p></span></p>
<p><span style="font-family:"Calibri","sans-serif";color:black"><o:p> </o:p></span></p>
<p><span style="font-family:"Calibri","sans-serif";color:black">Apologies for brining up an older thread, but does anyone have a script for removing over represented orientations from a data set? Preferably the script work with Relion's star file. Thanks.<o:p></o:p></span></p>
<p><span style="font-family:"Calibri","sans-serif";color:black"><o:p> </o:p></span></p>
<p><span style="font-family:"Calibri","sans-serif";color:black">Best wishes,<o:p></o:p></span></p>
<p><span style="font-family:"Calibri","sans-serif";color:black">Reza<o:p></o:p></span></p>
<p><span style="font-family:"Calibri","sans-serif";color:black"><o:p> </o:p></span></p>
<div id="Signature">
<div name="divtagdefaultwrapper">
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Calibri","sans-serif";color:black">Reza Khayat, PhD
<o:p></o:p></span></p>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Calibri","sans-serif";color:black">Assistant Professor <o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Calibri","sans-serif";color:black">City College of New York<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Calibri","sans-serif";color:black">Department of Chemistry<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Calibri","sans-serif";color:black">New York, NY 10031<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
<blockquote type="cite">
<div><span>_______________________________________________</span><br>
<span>3dem mailing list</span><br>
<span><a href="mailto:3dem@ncmir.ucsd.edu">3dem@ncmir.ucsd.edu</a></span><br>
<span><a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=https-3A__mail.ncmir.ucsd.edu_mailman_listinfo_3dem&d=DwICAg&c=6vgNTiRn9_pqCD9hKx9JgXN1VapJQ8JVoF8oWH1AgfQ&r=vDDf9rsFxPMXm8JgJa6hc4B9V4qKr7wftnDkLIRdshI&m=JSnwF2gEnjjfAzF_6H92TsLVPsztPJx6B_bs5h-CqgQ&s=ngiLZA76LMruAdUjf3d9krPYpAEDHkwL13fDgOKdsx0&e=">https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=https-3A__mail.ncmir.ucsd.edu_mailman_listinfo_3dem&d=DwICAg&c=6vgNTiRn9_pqCD9hKx9JgXN1VapJQ8JVoF8oWH1AgfQ&r=vDDf9rsFxPMXm8JgJa6hc4B9V4qKr7wftnDkLIRdshI&m=JSnwF2gEnjjfAzF_6H92TsLVPsztPJx6B_bs5h-CqgQ&s=ngiLZA76LMruAdUjf3d9krPYpAEDHkwL13fDgOKdsx0&e=</a></span><br>
</div>
</blockquote>
</div>
</body>
</html>