<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>
</head>
<body dir="ltr">
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;" dir="ltr">
<p>Dear colleagues,</p>
<p><br>
</p>
<p>We are excited to announce the release of CryoFIT, a program for fitting <span style="font-size: 12pt;">atomistic models to cryo-EM maps. The current version is designed for </span><span style="font-size: 12pt;">fitting lower resolution maps but this does
 not preclude use with higher </span><span style="font-size: 12pt;">resolution maps. The CryoFIT module is built on Gromacs and accessible </span><span style="font-size: 12pt;">through Phenix (https://www.phenix-online.org/documentation/reference/</span><span style="font-size: 12pt;">cryo_fit.html),
 currently via GitHub. It supports both the Phenix GUI and </span><span style="font-size: 12pt;">the command line.  CryoFIT is based on the algorithm in Kirmiziatltin, et </span><span style="font-size: 12pt;">al., Methods of Enzymology 2015 (<a href="https://doi.org/10.1016/bs.mie.2015.02.011" class="OWAAutoLink" id="LPlnk122829" previewremoved="true">https://doi.org/10.1016/bs.mie.2015.02.011</a>). </span><span style="font-size: 12pt;">This is
 an alpha version. Please send any feature requests and bug reports </span><span style="font-size: 12pt;">to Doo Nam Kim (doonam at lanl.gov).</span></p>
<p><span style="font-size: 12pt;"><br>
</span></p>
<p>Happy Modeling!</p>
<p><br>
</p>
<p>Karissa</p>
<p><br>
</p>
<div id="Signature">
<div style="font-family:Tahoma; font-size:13px">
<div style="font-family:Tahoma; font-size:13px">
<div style="font-family:Tahoma; font-size:13px">
<div style="font-family:Tahoma; font-size:13px">
<p class="p1">***********************************</p>
<p class="p1">Karissa Y. Sanbonmatsu</p>
<p class="p1">Principal Investigator</p>
<p class="p1">Theoretical Biology and Biophysics</p>
<p class="p1">Theoretical Division</p>
<p class="p1">Los Alamos National Laboratory</p>
<p class="p1">http://www.lanl.gov/projects/karissa</p>
<p class="p1"><a href="http://www.t6.lanl.gov/kys" target="_blank" id="LPNoLP">http://www.t10.lanl.gov/kys</a></p>
<p class="p1">***********************************</p>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>