
<html>

  <head>


    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=utf-8">

  </head>

  <body text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">

    <p>Dear RELION-users, <br>

      <br>

      With RELION version 2.0.4, a bug was introduced wherein each

      iteration of auto-refinement incorrectly used the same (identical)

      half-set reconstruction for alignment of all data. A degree of

      reference-bias is therefore present, with the effect that the

      reported resolution is higher than should be under "gold-standard"

      conditions. The FSC and reported resolution is still based on

      comparing two half-set reconstructions built from completely

      separate image data, but reconstructions are not entirely free

      from over-fitting artifacts. <br>

      <br>

      <b>This bug only affects refinements using half-sets, all

        classification results are unaffected and can be considered

        entirely correct. </b><br>

      <br>

      In order to claim a so-called "gold-standard" resolution, versions

      before and including 2.0.3, or version 2.1b1 (which is now

      available at <a class="moz-txt-link-freetext"

        href="https://github.com/3dem/relion">https://github.com/3dem/relion</a>)

      should be used. <b>This is strongly recommended</b>. There are

      also patches attached in case you require a specific version to

      run refinement. To apply a patch, simply go to your downloaded

      relion (github) directory and run <br>

    </p>

    <p><tt>git apply 2.<version>_AR.patch </tt><br>

    </p>

    <p>and then build and install. <br>

    </p>

    <p> We apologize for any inconvenience, but more importantly thank

      the community for making us aware of any issues. In this

      particular case Prof. Leonid Sazanov and Dr. Radostin Danev are

      both to credit, making sure RELION continues to produce reliable

      results.</p>

    <p>Sincerely, <br>

    </p>

    Björn Forsberg

  </body>

</html>