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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:Calibri;mso-fareast-language:EN-US">Dear all,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:Calibri;mso-fareast-language:EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:Calibri;mso-fareast-language:EN-US">I got the suggestion from two other list members that there is a typo, and that “cos(alpha_0)” should read “cos(alpha_n)”. With this change (and
 some now solved MATLAB-confusion regarding degrees and radians) I now managed to reproduce the tilt scheme given in the FEI-software Xplore3D, which was my objective!
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:Calibri;mso-fareast-language:EN-US"> <o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:Calibri;mso-fareast-language:EN-US">Thank all of you who answered and shed light on the matter, the 3dem-list delivers once again!<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:Calibri;mso-fareast-language:EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:Calibri;mso-fareast-language:EN-US">If anyone is interested in the code, just let me know.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:Calibri;mso-fareast-language:EN-US"> <o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:Calibri;mso-fareast-language:EN-US">Best regards</span><span style="font-size:11.0pt;font-family:Calibri;mso-fareast-language:EN-US"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:Calibri;mso-fareast-language:EN-US">Charlotte</span><span style="font-size:11.0pt;font-family:Calibri;mso-fareast-language:EN-US"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:Calibri;mso-fareast-language:EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:Calibri;mso-fareast-language:EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0cm 0cm 0cm">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-family:Calibri;color:black">Från: </span>
</b><span style="font-family:Calibri;color:black">3dem <3dem-bounces@ncmir.ucsd.edu> på uppdrag av Charlotte Hamngren Blomqvist <charlotte.hamngren.blomqvist@chalmers.se></span><span style="font-family:PMingLiU;color:black"><br>
</span><b><span style="font-family:Calibri;color:black">Datum: </span></b><span style="font-family:Calibri;color:black">fredag 31 mars 2017 11:22<br>
<b>Till: </b>"3dem@ncmir.ucsd.edu" <3dem@ncmir.ucsd.edu><br>
<b>Ämne: </b>[3dem] How to calculate tilt angles in Saxton acquisition scheme?<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US">Dear all,</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US"> </span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US">I am currently trying to print out all the tilt angles in a tilt series using the Saxton scheme. I find the reference Saxton 1984 unsatisfactory in <i>how</i> to actually calculate the values. Also, in “Electron tomography”,
 edited by J. Frank p. 143, it says:</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US">“In this [Saxton] scheme, the tilt angle varies as alpha_n+1 = alpha_n + arcsin(sin(alpha_0)*cos(alpha_0)).“</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US"> </span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US">As I interpret this expression, the last term on the right-hand side is a constant, and hence the tilt angles are distributed with an even angular increment throughout the series. This should not be constant!</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US"> </span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US">Please, can anyone shed some light on this? What am I missing here?</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US">  </span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US">Best regards,</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US">Charlotte Hamngren Blomqvist</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US"> </span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:Calibri"> </span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:10.5pt;font-family:Calibri;color:black">_______________________</span><o:p></o:p></p>
<div>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:10.5pt;font-family:Calibri;color:black">Charlotte Hamngren Blomqvist, PhD</span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:10.5pt;font-family:Calibri;color:black">Researcher</span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:10.5pt;font-family:Calibri;color:black"> </span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:10.5pt;font-family:Calibri;color:black">Department of Physics</span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:10.5pt;font-family:Calibri;color:black">Eva Olsson group</span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:10.5pt;font-family:Calibri;color:black">Chalmers University of Technology</span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:Calibri;color:black">SE-41296 Gothenburg, Sweden</span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:Calibri;color:black">Tel +46-(0)31 772 51 80</span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:Calibri;color:black"><a href="http://www.chalmers.se/">www.chalmers.se</a></span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:Calibri;color:black">E-mail: <a href="mailto:charlotte.hamngren@chalmers.se">charlotte.hamngren.blomqvist@chalmers.se</a></span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:Calibri;color:black"> </span><o:p></o:p></p>
</div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:Calibri;color:black;mso-fareast-language:EN-US">Visiting address: Fysikgränd 3, room F4417b</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
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