<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
Dear Charlotte,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">My Matlab code is all on <a href="http://GitHub.com" class="">GitHub.com</a>, at
<div class="">fsigworth/aEMCodeRepository</div>
<div class="">The basic functions for IO and other operations are in the aLibs folder, and aLibs/GriddingLib has code for projection and reconstruction.  See Test3DReconstruction.m there for an example that might be useful to you.  Please write if you have
 questions.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Fred Sigworth</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">
<div class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
Fred J. Sigworth<br class="">
Professor</div>
<div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
Cell Molec Physiology<br class="">
Biomedical Engineering</div>
<div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
Molec Biophys and Biochem</div>
<div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
Yale University<br class="">
333 Cedar Street<br class="">
New Haven, CT 06520<br class="">
<br class="">
<br class="">
<br class="">
</div>
</div>
<br class="">
<div>
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Mar 23, 2017, at 10:21 AM, Charlotte Hamngren Blomqvist <<a href="mailto:charlotte.hamngren.blomqvist@chalmers.se" class="">charlotte.hamngren.blomqvist@chalmers.se</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div class="WordSection1" style="page: WordSection1; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Calibri;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 11pt;" class="">Dear all,<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Calibri;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 11pt;" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Calibri;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 11pt;" class="">We need to simulate ET data in order to evaluate our experimental data. I think I have seen publications on this done in MATLAB previously, but I cannot find any. Could anyone please say which is the most
 commonly used add on / plugin for ET simulations with phantoms for MATLAB?<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Calibri;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 11pt;" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Calibri;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 11pt;" class="">Best wishes,<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Calibri;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 11pt;" class="">Charlotte<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Calibri;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 11pt;" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Calibri;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 10.5pt;" class="">_______________________<o:p class=""></o:p></span></div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Calibri;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 10.5pt;" class="">Charlotte Hamngren Blomqvist, PhD<o:p class=""></o:p></span></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Calibri;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 10.5pt;" class="">Researcher<o:p class=""></o:p></span></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Calibri;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 10.5pt;" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Calibri;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 10.5pt;" class="">Department of Physics<o:p class=""></o:p></span></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Calibri;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 10.5pt;" class="">Eva Olsson group<o:p class=""></o:p></span></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Calibri;" class="">
<span lang="EN-US" style="font-size: 10.5pt;" class="">Chalmers University of Technology<o:p class=""></o:p></span></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Calibri;" class="">
<span style="font-size: 10.5pt;" class="">SE-41296 Gothenburg, Sweden<o:p class=""></o:p></span></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Calibri;" class="">
<span style="font-size: 10.5pt;" class="">Tel +46-(0)31 772 51 80<o:p class=""></o:p></span></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Calibri;" class="">
<span style="font-size: 10.5pt;" class=""><a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__www.chalmers.se_&d=DwMGaQ&c=-dg2m7zWuuDZ0MUcV7Sdqw&r=e7bOO_DKM9G6vj6NDtKzkeHHaiHuA3psA-DUK9-3siU&m=5gTdGgGkNQubuTOpeQT1sXUWCYtZbZclsywdZaAXsuI&s=3ybKYPG48Vk5hLZxB_sN7ELCKdAgfgcrnsaiN-fnJSY&e=" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline;" class=""><span style="color: blue;" class="">www.chalmers.se</span></a><o:p class=""></o:p></span></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Calibri;" class="">
<span style="font-size: 10.5pt;" class="">E-mail: <a href="mailto:charlotte.hamngren@chalmers.se" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline;" class=""><span style="color: blue;" class="">charlotte.hamngren.blomqvist@chalmers.se</span></a><o:p class=""></o:p></span></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Calibri;" class="">
<span style="font-size: 10.5pt;" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
</div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Calibri;" class="">
<span style="font-size: 10.5pt;" class="">Visiting address: FysikgrÀnd 3, room F4417b</span><o:p class=""></o:p></div>
</div>
<span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255); float: none; display: inline !important;" class="">_______________________________________________</span><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
<span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255); float: none; display: inline !important;" class="">3dem
 mailing list</span><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
<a href="mailto:3dem@ncmir.ucsd.edu" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">3dem@ncmir.ucsd.edu</a><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
<a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=https-3A__mail.ncmir.ucsd.edu_mailman_listinfo_3dem&d=DwICAg&c=-dg2m7zWuuDZ0MUcV7Sdqw&r=e7bOO_DKM9G6vj6NDtKzkeHHaiHuA3psA-DUK9-3siU&m=5gTdGgGkNQubuTOpeQT1sXUWCYtZbZclsywdZaAXsuI&s=VJNWcZoXeQ1L_Nnqw59N5aNs0bdDeF_nWaV-js8lFP0&e=" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=https-3A__mail.ncmir.ucsd.edu_mailman_listinfo_3dem&d=DwICAg&c=-dg2m7zWuuDZ0MUcV7Sdqw&r=e7bOO_DKM9G6vj6NDtKzkeHHaiHuA3psA-DUK9-3siU&m=5gTdGgGkNQubuTOpeQT1sXUWCYtZbZclsywdZaAXsuI&s=VJNWcZoXeQ1L_Nnqw59N5aNs0bdDeF_nWaV-js8lFP0&e=</a><span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255); float: none; display: inline !important;" class=""><span class="Apple-converted-space"> </span></span><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
</div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
</div>
</body>
</html>