
<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=us-ascii"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">Dear all<div><br></div><div>I wanted to let you know that the Volume slicer (a web based slice viewer for EMDB entries) is now in full production. The viewer allows you to interactively view slices of the 3D reconstruction from 3 orthogonal directions.</div><div><br></div><div>The Volume slicer for EMDB entry EMD-#### can be accessed via a link of the type: <a href="http://pdbe.org/emd-####/3dslice">http://pdbe.org/emd-####/3dslice</a>, for example for EMD-6288 the link is: <a href="http://pdbe.org/emd-6288/3dslice">http://pdbe.org/emd-6288/3dslice</a></div><div><br></div><div><br></div><div>You can read more about the Volume slicer in the following paper: </div><div><span style="text-indent: -36px;"><br></span></div><div><span style="text-indent: -36px;">Salavert-Torres, J., Iudin, A., Lagerstedt, I., Sanz-Garcia, E., Kleywegt, G. J., & Patwardhan, A. (2016). Web-based volume slicer for 3D electron-microscopy data from EMDB. </span><i style="text-indent: -36px;">J Struct Biol, 194</i><span style="text-indent: -36px;">(2), 164-170. doi:10.1016/j.jsb.2016.02.012 (</span><a href="http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1047847716300272">http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1047847716300272</a><span style="text-indent: -36px;">)</span></div><div><span style="text-indent: -36px;"><br></span></div><div><span style="text-indent: -36px;">and in the following blog:</span></div><div><span style="text-indent: -36px;"><br></span></div><div><a href="http://www.ebi.ac.uk/pdbe/about/news/big-picture-3d-structure-molecules-cells">http://www.ebi.ac.uk/pdbe/about/news/big-picture-3d-structure-molecules-cells</a></div><div><br></div><div>We welcome your feedback and comments!</div><div><br></div><div>Many thanks and best wishes</div><div><br></div><div>Ardan</div><br><div><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;"><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;"><div>Ardan Patwardhan</div><div>Coordinator - cellular structure & PDBe production<br>Protein Data Bank in Europe (PDBe)</div><div>European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) European Molecular Biology Laboratory<br>Wellcome Trust Genome Campus<br>Hinxton, Cambridge CB10 1SD<br>Tel: +44 1223 492649</div></div></div></div></body></html>